A Rota dos Jesuítas é o segredo mais bem guardado do Paraguai. O Paraguai possui atualmente 8 municípios jesuítas guaranis, dos 30 que foram construídos no território da Paraqvaria nos séculos XVII e XVIII. San Ignacio Guazú é a mais antiga das cidades jesuítas Guarani da antiga Província de Paraqvaria, localizada no departamento de Misiones e atual capital da Arte Barroca Guarani, onde se destaca o Museu Diocesano Guarani de Arte Jesuíta, com sua notável talha. A Rota segue até Santa María de la Fe, em que o artesanato de seus habitantes se destaca pela cor, seus bordados peculiares e originalidade. A viagem continua até o povoado de Santa Rosa de Lima, que guarda, na Capela de Loreto, a única pintura afresco da época ainda existente e mantém a tradição jesuíta guarani da cidade de Santiago Apóstol e o encanto de seus principais quadrado.
As maiores obras na construção do período fundacional dos Jesuítas Guarani nos levam ao departamento de Itapúa, onde os Jesuítas Guarani de San Cosme y San Damián transcendem em ciência e conhecimento do céu guarani, graças aos trabalhos e estudos sobre Astronomia, do padre Buenaventura Suárez, que construiu telescópios, quadrantes astronômicos e um relógio de sol com materiais que pôde obter na própria missão, como cristais de quartzo que encontrou nas margens do rio Paraná para fazer as lentes. Atualmente abriga o Centro de Interpretação Astronômica Buenaventura Suárez em homenagem ao padre jesuíta que construiu no local o segundo observatório do continente.
A Missão de Nossa Senhora da Encarnação de Itapúa, atualmente cidade de Encarnação e conhecida como Pérola do Sul, é a Capital da Rota dos Jesuítas e palco de uma das maiores conquistas da época: a livre entrega de escravos reclamados pelos Guaraní. A atual Praça Central, chamada De Armas, foi palco da antiga missão de Itapúa, fundada pelo único santo e jesuíta paraguaio, São Roque González de Santa Cruz.
A imortalidade desse modelo de organização entre padres guaranis e jesuítas transparece na magnitude da obra da Missão de Santíssima Trindade do Paraná e a Missão de Jesus de Tavarangué, ambas as missões declaradas Patrimônio Mundial da Humanidade, onde a grande mística daquela civilização persiste até hoje na língua guarani, na arte, na música, na ciência, na arquitetura, nos costumes e na gastronomia de uma identidade única no povo paraguaio.
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